Doktorandin / Doktorand (d/w/m) Klinik für Infektiologie und Intensivmedizin

Arbeiten an der Charité
Der Fächerverbund für Infektiologie, Pneumologie und Intensivmedizin widmet sich der translationalen Erforschung von Infektions- und Lungenerkrankungen. Die Arbeitsgruppe Sander hat zum Ziel, Wirt-Pathogen-Interaktionen sowie die Mechanismen protektiver Immunität zur Entwicklung und Optimierung neuer Impfstoffe und antimikrobieller Therapien gegen Infektionskrankheiten zu erforschen. Die Arbeitsgruppe Gröschel beschäftigt sich mit neuen Ansätzen zur Diagnostik, Therapie und Prognose der Tuberkulose sowie der Entwicklung und Evaluation von KI-Werkzeugen für die klinische Praxis. Unser junges und interdisziplinäres Team bietet eine abwechslungsreiche Tätigkeit mit zahlreichen Gestaltungs- und Entwicklungsmöglichkeiten in kollegialer Arbeitsatmosphäre.
Als Teil der in unserer Klinik angesiedelten DFG-Forschungsgruppe „Krankenhausassoziierte Infektionen – Aufklärung schützender und prädisponierender Faktoren zur Entwicklung neuartiger prophylaktischer Strategien (HAI)“ untersuchen die AG Sander, AG Gröschel und AG Buchauer die Rolle von T-Zellen bei nosokomialen Infektionen. Während die Rolle von T-Zellen bei viralen Erkrankungen recht gut verstanden ist, ist die Rolle von T-Zellen bei bakteriellen Infektionen – insbesondere beim Übergang von Besiedelung zu invasiver Infektion – weitgehend unklar. Im Rahmen des Projekts soll durch die Charakterisierung pathogen-reaktiver T-Zellen aus Patientenkohorten, inklusive Einzelzellsequenzierung und TCR-Sequenzierung sowie paralleler Pathogensequenzierung und bioinformatischer Analysen der Zusammenhang zwischen bestehender T-Zell-Immunität, bakteriellen Virulenzmarkern und der Entstehung nosokomialer Infektionen erforscht werden. Das Projekt verbindet Grundlagen- und angewandte Forschung und hat zum Ziel die Diagnostik und Prävention von krankenhausassoziierten Infektionen zu verbessern. Hierfür suchen wir eine motivierte Doktorandin/einen motivierten Doktoranden zur Durchführung der Laborarbeiten und Mitwirkung bei bioinformatischen Analysen.
Die Stelle im Überblick

• Sie sind zuständig für die Verarbeitung klinischer Proben, inklusive der Durchführung fortgeschrittener zellulärer immunologischer Assays (Zellisolierung, T-Zell-Stimulation, MACS- und FACS-basierte Zellisolierung und -Sortierung, Vorbereitung von Einzelzellsequenzierung funktioneller T-Zell-Assays)
• Sie übernehmen die Vorbereitung von Proben für das Next-Generation-Sequencing
• Sie tragen in enger Zusammenarbeit mit dem im Projekt angestellten PostDoc zur bioinformatischen Analyse der Daten bei
• Sie arbeiten im Rahmen der Probensammlung mit den klinischen Projektpartnern und für die Zellsortierung und Sequenzierung mit den Core Facilities zusammen
• Sie wirken mit bei der Erstellung von Manuskripten und der Präsentation von Forschungsergebnissen auf nationalen und internationalen Konferenzen
• Sie werden als wissenschaftliche Mitarbeiterin / wissenschaftlicher Mitarbeiter beschäftigt: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor

Danach suchen wir

• Sie verfügen über ein abgeschlossenes Studium im Bereich der molekularen Biologie (oder vergleichbar) sowie fundierte Kenntnisse in der Immunologie, Mikrobiologie oder molekularen Zellbiologie mit starkem Interesse an Infektionen und Wirt-Pathogen-Interaktionen
• Sie konnten idealerweise bereits praktische Erfahrung mit Zellaufreinigung und Durchflusszytometrie sammeln
• Sie verfügen idealerweise über grundlegende praktische oder konzeptionelle Erfahrung mit Einzelzell-Sequenzierungstechnologien oder haben ein starkes Interesse am Erlernen und Anwenden dieser Methoden
• Sie bringen die Fähigkeit zur Durchführung grundlegender bioinformatischer Analysen von Einzelzell-Sequenzierungsdatensätzen mit oder haben die starke Bereitschaft, diese Fähigkeiten zu erwerben
• Sie zeichnen sich aus durch intellektuelle Neugier mit ausgeprägtem Verantwortungsbewusstsein.
• Sie besitzen die Fähigkeit, sowohl selbstständig als auch kooperativ in einem interdisziplinären Umfeld mit Wissenschaftlern aus dem Labor- und Core-Facility-Bereich sowie mit Bioinformatikern zu arbeiten
• Sie können sehr gut schriftlich und mündlich auf Englisch kommunizieren

Das bringt die Charité mit

• Eine hoch professionelle Zusammenarbeit in einem motivierten und interdisziplinären Team
• Eine zukunftsorientierte, abwechslungsreiche und anspruchsvolle Tätigkeit mit hoher Eigenverantwortung und persönlichem Handlungsspielraum
• Umfangreiche kostenfreie Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten
• Vergünstigungen bei vielen Angeboten für Beschäftigte für die Bereiche Shopping, Reisen, Sport
• Eine zusätzliche Absicherung im Alter durch unsere betriebliche Altersvorsorge
• Seit 2007 zertifiziert als familiengerechte Hochschule und familiengerechtes Unternehmen - Weitere Informationen finden Sie hier